با پیشرفت علم به مرور ویدئو میکروسکوپ¬های دیجیتال به بازار آمد که کاربر این دستگاه از روش¬های قدیمی بسیار بیشتر است. اساس ساختار این دستگاه بر پایه دوربین با کیفیت با لنزهای قدرتمند است.که به وسیله آن عکس می‌توان عکس هایی با وضوح بالا تهیه کرد. در ضمن می¬توان این عکس¬ها را به کامپیوتر انتقال داد و توسط نرم افزار های پردازش تصویر بر روی اندازه، رنگ، وضوح، شفافیت و... آن ها کار کرد. به عنوان مثال می¬توان توسط آن اندازه اشیائی را که در عکس گرفته شده قرار دارد را اندازه-گیری نمود. دیجیتال میکروسکوپ¬ها در سه نوع پزشکی، صنعتی و دانش آموزی وجود دارند.

در نوع صنعتی این دستگاه که بیشتر از میکروسکوپ¬های لوپ استفاده می¬شود برای دیدن اجسام بزرگ مورد استفاده قرار می‌گیرد.به عنوان مثال برای دیدن قطعات الکترونیکی بسار ریز از این دستگاه استفاده می¬شود. دیجیتال ویدئو میکروسکوپ های پزشکی نیز بیشتر در زمینه پاتولوژی و.... مورد استفاده قرار می گیرند. میکروسکوپ‌های دانش آموزی نیز معمولا دارای کیفیت پایین¬تری نسبت به انواع قبل هستند. برای کارهای آموزشی به ویژه مدارس مورد استفاده قرار می‌گیرند.